Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms