Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF542PQ5EBM4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms