Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms