Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI3KQ59H18 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms