Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms