Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANKRD39Q53RE8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms