Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms