Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP19-7Q3SYF9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms