Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HFEQ30201 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HFEQ30201 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HFEQ30201 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HFEQ30201 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HFEQ30201 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HFEQ30201 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HFEQ30201 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HFEQ30201 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HFEQ30201 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HFEQ30201 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HFEQ30201 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HFEQ30201 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HFEQ30201 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HFEQ30201 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HFEQ30201 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HFEQ30201 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HFEQ30201 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HFEQ30201 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms