Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms