Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CA9Q16790 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CA9Q16790 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CA9Q16790 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CA9Q16790 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CA9Q16790 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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CA9Q16790 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA9Q16790 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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CA9Q16790 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA9Q16790 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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CA9Q16790 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CA9Q16790 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA9Q16790 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CA9Q16790 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CA9Q16790 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA9Q16790 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA9Q16790 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA9Q16790 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA9Q16790 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CA9Q16790 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA9Q16790 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CA9Q16790 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CA9Q16790 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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