Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
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