Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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SEC23BQ15437 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SEC23BQ15437 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SEC23BQ15437 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SEC23BQ15437 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SEC23BQ15437 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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SEC23BQ15437 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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SEC23BQ15437 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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