Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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