Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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