Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
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