Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PDE6HQ13956 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PDE6HQ13956 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PDE6HQ13956 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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PDE6HQ13956 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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PDE6HQ13956 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PDE6HQ13956 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PDE6HQ13956 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PDE6HQ13956 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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