Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
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