Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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DDX39BQ13838 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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