Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
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SHROOM2Q13796 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
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SHROOM2Q13796 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
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SHROOM2Q13796 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
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SHROOM2Q13796 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
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SHROOM2Q13796 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
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SHROOM2Q13796 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
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SHROOM2Q13796 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
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SHROOM2Q13796 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
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SHROOM2Q13796 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
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