Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTR4Q13639 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTR4Q13639 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTR4Q13639 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTR4Q13639 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HTR4Q13639 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTR4Q13639 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTR4Q13639 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTR4Q13639 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTR4Q13639 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HTR4Q13639 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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