Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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C1orf61Q13536 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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C1orf61Q13536 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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