Protein–RNA interactions for Protein: Q13506

NAB1, NGFI-A-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB1Q13506 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NAB1Q13506 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAB1Q13506 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms