Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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