Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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