Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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SKP2Q13309 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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SKP2Q13309 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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