Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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