Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TROQ12816 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TROQ12816 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TROQ12816 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TROQ12816 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TROQ12816 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TROQ12816 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TROQ12816 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TROQ12816 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TROQ12816 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TROQ12816 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TROQ12816 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TROQ12816 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TROQ12816 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TROQ12816 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TROQ12816 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TROQ12816 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TROQ12816 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TROQ12816 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TROQ12816 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TROQ12816 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
TROQ12816 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TROQ12816 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TROQ12816 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TROQ12816 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TROQ12816 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TROQ12816 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TROQ12816 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TROQ12816 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TROQ12816 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TROQ12816 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
TROQ12816 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TROQ12816 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TROQ12816 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TROQ12816 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TROQ12816 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TROQ12816 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TROQ12816 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TROQ12816 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TROQ12816 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TROQ12816 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TROQ12816 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TROQ12816 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TROQ12816 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TROQ12816 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TROQ12816 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TROQ12816 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TROQ12816 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TROQ12816 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TROQ12816 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TROQ12816 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TROQ12816 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TROQ12816 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TROQ12816 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TROQ12816 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TROQ12816 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TROQ12816 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TROQ12816 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TROQ12816 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TROQ12816 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TROQ12816 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TROQ12816 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TROQ12816 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TROQ12816 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TROQ12816 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
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