Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 NAB6YML117W 3405 nt2.63□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 SPF1YEL031W 3648 nt2.62□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 DNF1YER166W 4716 nt2.62□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 snR84snR84 550 nt2.62□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 PEX4YGR133W 552 nt2.62□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 OTU2YHL013C 924 nt2.62□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YIR020CYIR020C 303 nt2.62□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.62□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YLR302CYLR302C 363 nt2.62□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 TMA10YLR327C 261 nt2.62□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.62□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 RBL2YOR265W 321 nt2.62□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 NSL1YPL233W 651 nt2.62□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 SSE1YPL106C 2082 nt2.62□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 VTC1YER072W 390 nt2.61□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YIL029CYIL029C 429 nt2.61□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 STE18YJR086W 333 nt2.61□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YJR141WYJR141W 1044 nt2.61□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.61□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 RPL36AYMR194W 303 nt2.61□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 MRPL33YMR286W 261 nt2.61□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 MPP6YNR024W 561 nt2.61□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YOR283WYOR283W 693 nt2.61□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YPR172WYPR172W 603 nt2.61□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YPR203WYPR203W 309 nt2.61□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.6□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YDR250CYDR250C 276 nt2.6□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 RPL29YFR032C-A 180 nt2.6□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 PRS3YHL011C 963 nt2.6□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 RNP1YLL046C 750 nt2.6□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YLR252WYLR252W 306 nt2.6□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 KTI11YBL071W-A 249 nt2.6□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YOL134CYOL134C 390 nt2.6□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 RCN2YOR220W 798 nt2.6□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 SSF1YHR066W 1362 nt2.6□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YBT1YLL048C 4986 nt2.6□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 SNX41YDR425W 1878 nt2.59□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 TSA2YDR453C 591 nt2.59□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 VPS51YKR020W 495 nt2.59□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 RPS1AYLR441C 768 nt2.59□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 CSI1YMR025W 888 nt2.59□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.59□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 SWM2YNR004W 441 nt2.59□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 CRS5YOR031W 210 nt2.59□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YBR071WYBR071W 636 nt2.59□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 YPR096CYPR096C 303 nt2.59□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 Q0017Q0017 162 nt2.59□□□□□ -1.99
RIM20Q12033 SSF2YDR312W 1362 nt2.59□□□□□ -2
RIM20Q12033 RLI1YDR091C 1827 nt2.58□□□□□ -2
RIM20Q12033 YNL034WYNL034W 1839 nt2.58□□□□□ -2
RIM20Q12033 PSO2YMR137C 1986 nt2.58□□□□□ -2
RIM20Q12033 YJL202CYJL202C 348 nt2.58□□□□□ -2
RIM20Q12033 ILM1YJR118C 612 nt2.58□□□□□ -2
RIM20Q12033 VPH2YKL119C 648 nt2.58□□□□□ -2
RIM20Q12033 LSM2YBL026W 288 nt2.58□□□□□ -2
RIM20Q12033 LOA1YPR139C 903 nt2.58□□□□□ -2
RIM20Q12033 BI4Q0120 1917 nt2.58□□□□□ -2
RIM20Q12033 GCN4YEL009C 846 nt2.57□□□□□ -2
RIM20Q12033 RPS24AYER074W 408 nt2.57□□□□□ -2
RIM20Q12033 MPO1YGL010W 525 nt2.57□□□□□ -2
RIM20Q12033 YGL015CYGL015C 393 nt2.57□□□□□ -2
RIM20Q12033 YHC1YLR298C 696 nt2.57□□□□□ -2
RIM20Q12033 JID1YPR061C 906 nt2.57□□□□□ -2
RIM20Q12033 JSN1YJR091C 3276 nt2.57□□□□□ -2
RIM20Q12033 UTP22YGR090W 3714 nt2.57□□□□□ -2
RIM20Q12033 BAS1YKR099W 2436 nt2.57□□□□□ -2
RIM20Q12033 ECM25YJL201W 1800 nt2.56□□□□□ -2
RIM20Q12033 HRD3YLR207W 2502 nt2.56□□□□□ -2
RIM20Q12033 CRD1YDL142C 852 nt2.56□□□□□ -2
RIM20Q12033 GIC1YHR061C 945 nt2.56□□□□□ -2
RIM20Q12033 ARV1YLR242C 966 nt2.56□□□□□ -2
RIM20Q12033 BER1YLR412W 825 nt2.56□□□□□ -2
RIM20Q12033 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.56□□□□□ -2
RIM20Q12033 SPR3YGR059W 1539 nt2.56□□□□□ -2
RIM20Q12033 TRA1YHR099W 11235 nt2.56□□□□□ -2
RIM20Q12033 UFD4YKL010C 4452 nt2.56□□□□□ -2
RIM20Q12033 SWR1YDR334W 4545 nt2.56□□□□□ -2
RIM20Q12033 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.55□□□□□ -2
RIM20Q12033 YFR016CYFR016C 3702 nt2.55□□□□□ -2
RIM20Q12033 RAD6YGL058W 519 nt2.55□□□□□ -2
RIM20Q12033 YGR050CYGR050C 357 nt2.55□□□□□ -2
RIM20Q12033 LAG1YHL003C 1236 nt2.55□□□□□ -2
RIM20Q12033 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.55□□□□□ -2
RIM20Q12033 AFB1YLR040C 675 nt2.55□□□□□ -2
RIM20Q12033 ALK2YBL009W 2031 nt2.55□□□□□ -2
RIM20Q12033 PSK2YOL045W 3306 nt2.55□□□□□ -2
RIM20Q12033 TRM7YBR061C 933 nt2.55□□□□□ -2
RIM20Q12033 ISW1YBR245C 3390 nt2.55□□□□□ -2
RIM20Q12033 AMS1YGL156W 3252 nt2.55□□□□□ -2
RIM20Q12033 SAP185YJL098W 3177 nt2.55□□□□□ -2
RIM20Q12033 YCR108CYCR108C 192 nt2.54□□□□□ -2
RIM20Q12033 YBL108WYBL108W 306 nt2.54□□□□□ -2
RIM20Q12033 TOP2YNL088W 4287 nt2.54□□□□□ -2
RIM20Q12033 INP51YIL002C 2841 nt2.54□□□□□ -2
RIM20Q12033 ECM5YMR176W 4236 nt2.53□□□□□ -2
RIM20Q12033 IRC8YJL051W 2469 nt2.53□□□□□ -2
RIM20Q12033 YOL098CYOL098C 3114 nt2.53□□□□□ -2
RIM20Q12033 YDR199WYDR199W 366 nt2.53□□□□□ -2
RIM20Q12033 SPO13YHR014W 876 nt2.53□□□□□ -2
RIM20Q12033 ATP7YKL016C 525 nt2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.2 ms