Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms