Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms