Protein–RNA interactions for Protein: Q08972

NEW1, [NU+] prion formation protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEW1Q08972 ERV1YGR029W 570 nt3.09□□□□□ -1.91
NEW1Q08972 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt3.09□□□□□ -1.91
NEW1Q08972 YKL044WYKL044W 321 nt3.09□□□□□ -1.91
NEW1Q08972 HSP10YOR020C 321 nt3.09□□□□□ -1.91
NEW1Q08972 RPL33AYPL143W 324 nt3.09□□□□□ -1.91
NEW1Q08972 RRD2YPL152W 1077 nt3.09□□□□□ -1.91
NEW1Q08972 YME2YMR302C 2553 nt3.09□□□□□ -1.91
NEW1Q08972 GDI1YER136W 1356 nt3.09□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 APC2YLR127C 2562 nt3.08□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 GPI19YDR437W 423 nt3.08□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 GCN4YEL009C 846 nt3.08□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 RPS26BYER131W 360 nt3.08□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 HOP2YGL033W 657 nt3.08□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YAP3YHL009C 993 nt3.08□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 PEP12YOR036W 867 nt3.08□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YOR282WYOR282W 321 nt3.08□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YOR392WYOR392W 444 nt3.08□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 TRM2YKR056W 1920 nt3.08□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 STE6YKL209C 3873 nt3.08□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 BFR1YOR198C 1413 nt3.08□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 BUD4YJR092W 4344 nt3.08□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 SLH1YGR271W 5904 nt3.08□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 FUS1YCL027W 1539 nt3.08□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 MET6YER091C 2304 nt3.08□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YJR098CYJR098C 1971 nt3.07□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 ROG1YGL144C 2058 nt3.07□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 RRM3YHR031C 2172 nt3.07□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 AST2YER101C 1293 nt3.07□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 CSE4YKL049C 690 nt3.07□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YKL083WYKL083W 615 nt3.07□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 UNG1YML021C 1080 nt3.07□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 COQ10YOL008W 624 nt3.07□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YPL197CYPL197C 414 nt3.07□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 NDT80YHR124W 1884 nt3.07□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 SNQ2YDR011W 4506 nt3.06□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 MRH1YDR033W 963 nt3.06□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YDR537CYDR537C 606 nt3.06□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 SMB1YER029C 591 nt3.06□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YGR242WYGR242W 309 nt3.06□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YJR079WYJR079W 330 nt3.06□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 MRPL31YKL138C 396 nt3.06□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 TRZ1YKR079C 2517 nt3.06□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 APC9YLR102C 798 nt3.06□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.06□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 PFF1YBR074W 2931 nt3.06□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 SPB1YCL054W 2526 nt3.06□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 SIP3YNL257C 3690 nt3.06□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 DAL5YJR152W 1632 nt3.05□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 JIP5YPR169W 1479 nt3.05□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 HPA3YEL066W 540 nt3.05□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.05□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 RPS22AYJL190C 393 nt3.05□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 ABM1YJR108W 372 nt3.05□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YKL066WYKL066W 444 nt3.05□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YKL136WYKL136W 399 nt3.05□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YKR033CYKR033C 426 nt3.05□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YOR331CYOR331C 558 nt3.05□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YGR067CYGR067C 2415 nt3.05□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 OST1YJL002C 1431 nt3.04□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 IRC2YDR112W 309 nt3.04□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 HMF1YER057C 390 nt3.04□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YML108WYML108W 318 nt3.04□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 OST2YOR103C 393 nt3.04□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 CWC22YGR278W 1734 nt3.04□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 CCT7YJL111W 1653 nt3.04□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 DUG2YBR281C 2637 nt3.04□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 PPN1YDR452W 2025 nt3.03□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 COG3YER157W 2406 nt3.03□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 SSN2YDR443C 4263 nt3.03□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 CDC20YGL116W 1833 nt3.03□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt3.03□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt3.03□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt3.03□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 RTT10YPL183C 3042 nt3.03□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 NPR3YHL023C 3441 nt3.03□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 SIN3YOL004W 4611 nt3.03□□□□□ -1.92
NEW1Q08972 FIR1YER032W 2631 nt3.03□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 RLF2YPR018W 1821 nt3.03□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 INP52YNL106C 3552 nt3.02□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt3.02□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 YKL118WYKL118W 312 nt3.02□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 YLR012CYLR012C 300 nt3.02□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 YLR230WYLR230W 306 nt3.02□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 snR54snR54 86 nt3.02□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 NPR1YNL183C 2373 nt3.01□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 ESL1YIL151C 3357 nt3.01□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 DYN2YDR424C 279 nt3.01□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 RPL23BYER117W 414 nt3.01□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 AAD16YFL057C 459 nt3.01□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 YGL015CYGL015C 393 nt3.01□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 MBB1YJL199C 327 nt3.01□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 BSC3YLR465C 309 nt3.01□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 YML009C-AYML009C-A 327 nt3.01□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt3.01□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 DBP7YKR024C 2229 nt3.01□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 RRI2YOL117W 1938 nt3.01□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 BNA4YBL098W 1383 nt3□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 IKI3YLR384C 4050 nt3□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 NHP2YDL208W 471 nt3□□□□□ -1.93
NEW1Q08972 snR8snR8 190 nt3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.1 ms