Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms