Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms