Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms