Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms