Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 353.8 ms