Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK6Q00534 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms