Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD1P98174 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD1P98174 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD1P98174 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD1P98174 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD1P98174 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD1P98174 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD1P98174 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD1P98174 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD1P98174 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD1P98174 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD1P98174 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD1P98174 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD1P98174 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD1P98174 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD1P98174 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD1P98174 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD1P98174 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD1P98174 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD1P98174 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD1P98174 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD1P98174 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD1P98174 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD1P98174 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD1P98174 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD1P98174 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD1P98174 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD1P98174 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD1P98174 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD1P98174 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD1P98174 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD1P98174 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD1P98174 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms