Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRB1P82279 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRB1P82279 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRB1P82279 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRB1P82279 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRB1P82279 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRB1P82279 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRB1P82279 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRB1P82279 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRB1P82279 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRB1P82279 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRB1P82279 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRB1P82279 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRB1P82279 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRB1P82279 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CRB1P82279 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CRB1P82279 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRB1P82279 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRB1P82279 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRB1P82279 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRB1P82279 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRB1P82279 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRB1P82279 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRB1P82279 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRB1P82279 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRB1P82279 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRB1P82279 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRB1P82279 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRB1P82279 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRB1P82279 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRB1P82279 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRB1P82279 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRB1P82279 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRB1P82279 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRB1P82279 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRB1P82279 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CRB1P82279 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRB1P82279 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRB1P82279 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRB1P82279 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRB1P82279 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRB1P82279 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRB1P82279 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRB1P82279 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRB1P82279 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CRB1P82279 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CRB1P82279 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CRB1P82279 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CRB1P82279 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRB1P82279 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRB1P82279 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRB1P82279 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRB1P82279 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRB1P82279 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CRB1P82279 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CRB1P82279 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms