Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP46P62068 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP46P62068 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP46P62068 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP46P62068 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP46P62068 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP46P62068 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP46P62068 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP46P62068 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP46P62068 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP46P62068 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP46P62068 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP46P62068 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP46P62068 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP46P62068 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP46P62068 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP46P62068 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP46P62068 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP46P62068 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP46P62068 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP46P62068 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP46P62068 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP46P62068 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP46P62068 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP46P62068 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP46P62068 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP46P62068 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP46P62068 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP46P62068 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP46P62068 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP46P62068 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP46P62068 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP46P62068 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP46P62068 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP46P62068 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP46P62068 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP46P62068 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP46P62068 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP46P62068 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP46P62068 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP46P62068 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP46P62068 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP46P62068 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP46P62068 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP46P62068 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP46P62068 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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