Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms