Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL23P55773 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL23P55773 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL23P55773 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL23P55773 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL23P55773 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL23P55773 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL23P55773 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL23P55773 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL23P55773 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL23P55773 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL23P55773 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCL23P55773 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCL23P55773 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCL23P55773 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL23P55773 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL23P55773 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL23P55773 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL23P55773 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL23P55773 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL23P55773 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL23P55773 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL23P55773 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL23P55773 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL23P55773 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL23P55773 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL23P55773 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL23P55773 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL23P55773 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL23P55773 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL23P55773 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL23P55773 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL23P55773 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL23P55773 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL23P55773 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL23P55773 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL23P55773 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL23P55773 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL23P55773 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL23P55773 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL23P55773 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL23P55773 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL23P55773 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL23P55773 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL23P55773 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms