Protein–RNA interactions for Protein: P55318

FOXA3, Hepatocyte nuclear factor 3-gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXA3P55318 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXA3P55318 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms