Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRPF1P55201 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms