Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA4P51532 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms