Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK7P50613 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK7P50613 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK7P50613 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK7P50613 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK7P50613 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK7P50613 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK7P50613 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK7P50613 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK7P50613 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK7P50613 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK7P50613 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK7P50613 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK7P50613 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK7P50613 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK7P50613 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK7P50613 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK7P50613 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK7P50613 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK7P50613 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK7P50613 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK7P50613 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK7P50613 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK7P50613 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK7P50613 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK7P50613 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK7P50613 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK7P50613 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms