Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSSP48449 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSSP48449 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSSP48449 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LSSP48449 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LSSP48449 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSSP48449 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSSP48449 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSSP48449 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSSP48449 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSSP48449 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSSP48449 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSSP48449 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSSP48449 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSSP48449 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSSP48449 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSSP48449 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSSP48449 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSSP48449 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSSP48449 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSSP48449 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSSP48449 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSSP48449 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSSP48449 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSSP48449 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSSP48449 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSSP48449 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSSP48449 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSSP48449 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LSSP48449 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSSP48449 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSSP48449 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSSP48449 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSSP48449 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSSP48449 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSSP48449 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSSP48449 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSSP48449 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSSP48449 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LSSP48449 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSSP48449 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSSP48449 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LSSP48449 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms