Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX5P48382 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX5P48382 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX5P48382 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX5P48382 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX5P48382 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX5P48382 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX5P48382 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX5P48382 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX5P48382 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX5P48382 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX5P48382 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX5P48382 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX5P48382 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX5P48382 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX5P48382 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX5P48382 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX5P48382 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX5P48382 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX5P48382 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX5P48382 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX5P48382 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX5P48382 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX5P48382 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX5P48382 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX5P48382 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX5P48382 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX5P48382 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX5P48382 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX5P48382 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX5P48382 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX5P48382 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX5P48382 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX5P48382 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX5P48382 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX5P48382 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX5P48382 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX5P48382 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX5P48382 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX5P48382 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX5P48382 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX5P48382 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX5P48382 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX5P48382 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX5P48382 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX5P48382 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX5P48382 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX5P48382 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX5P48382 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX5P48382 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX5P48382 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX5P48382 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX5P48382 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX5P48382 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX5P48382 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX5P48382 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX5P48382 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX5P48382 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX5P48382 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX5P48382 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX5P48382 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX5P48382 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX5P48382 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX5P48382 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX5P48382 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX5P48382 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX5P48382 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX5P48382 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX5P48382 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX5P48382 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX5P48382 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX5P48382 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX5P48382 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX5P48382 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX5P48382 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX5P48382 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX5P48382 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX5P48382 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX5P48382 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX5P48382 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX5P48382 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX5P48382 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms