Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPL28P46779 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPL28P46779 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPL28P46779 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPL28P46779 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPL28P46779 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPL28P46779 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPL28P46779 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPL28P46779 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPL28P46779 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPL28P46779 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPL28P46779 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPL28P46779 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RPL28P46779 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPL28P46779 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RPL28P46779 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPL28P46779 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RPL28P46779 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPL28P46779 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RPL28P46779 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RPL28P46779 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RPL28P46779 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPL28P46779 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RPL28P46779 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL28P46779 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL28P46779 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL28P46779 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL28P46779 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL28P46779 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL28P46779 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL28P46779 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL28P46779 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL28P46779 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL28P46779 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL28P46779 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL28P46779 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL28P46779 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL28P46779 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL28P46779 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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